学术不端查重论文的危害主要体现在以下几个方面：首先，严重损害学术诚信，破坏学术界的规范秩序。其次，影响学术研究的真实性和可信度，降低学术研究的价值和意义。再者，可能导致学术界的信任危机，影响学者之间的合作与交流。最后，对科研机构和学术期刊造成负面影响，降低其声誉和影响力。

此外，学术不端查重论文还可能导致学术造假现象的蔓延，使得学术研究的水平和质量下降，影响整个学术界的发展。同时，对于学术机构和学术期刊而言，大量的学术不端查重论文也会增加其审核工作的难度和成本，影响学术资源的合理利用。因此，认识并警惕学术不端查重论文的危害，对于维护学术界的健康发展至关重要。